Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms