Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMARCD3Q6STE5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms