Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L2Q6R6M4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L2Q6R6M4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms