Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A47Q6Q0C1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A47Q6Q0C1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms