Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC62Q6P9F0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms