Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD54Q6NXT1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms