Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZNF544Q6NX49 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms