Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDF6Q6KF10 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GDF6Q6KF10 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms