Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCAPH2Q6IBW4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms