Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTUD7BQ6GQQ9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms