Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CARMIL2Q6F5E8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms