Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VIRMAQ69YN4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIRMAQ69YN4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIRMAQ69YN4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIRMAQ69YN4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
VIRMAQ69YN4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms