Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUPD1Q68J44 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUPD1Q68J44 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms