Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF123Q5XPI4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms