Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MALRD1Q5VYJ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MALRD1Q5VYJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms