Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GARNL3Q5VVW2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms