Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1orf53Q5VUE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms