Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LDLRAD1Q5T700 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LDLRAD1Q5T700 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms