Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC183Q5T5S1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms