Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EFHC1Q5JVL4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EFHC1Q5JVL4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms