Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP78Q5JTW2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP78Q5JTW2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms