Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERC4Q5GLZ8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERC4Q5GLZ8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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