Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAVIN4Q5BKX8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms