Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI3KQ59H18 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3KQ59H18 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms