Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC93Q567U6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms