Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAN2Q504Q3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAN2Q504Q3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAN2Q504Q3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAN2Q504Q3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PAN2Q504Q3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PAN2Q504Q3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PAN2Q504Q3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAN2Q504Q3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms