Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDRF1Q3B7T1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDRF1Q3B7T1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms