Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TWISTNBQ3B726 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TWISTNBQ3B726 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms