Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GEN1Q17RS7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GEN1Q17RS7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms