Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLPPQ16740 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CLPPQ16740 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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