Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGCBQ16585 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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SGCBQ16585 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SGCBQ16585 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCBQ16585 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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