Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC18A3Q16572 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC18A3Q16572 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms