Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CNGA3Q16281 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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CNGA3Q16281 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CNGA3Q16281 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CNGA3Q16281 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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