Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK4Q16099 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK4Q16099 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms