Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GRK1Q15835 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRK1Q15835 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms