Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALX1Q15699 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX1Q15699 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
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