Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TAF1AQ15573 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TAF1AQ15573 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
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