Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TAF1CQ15572 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TAF1CQ15572 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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