Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPAQ15257 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPAQ15257 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms