Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
R3HDM1Q15032 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
R3HDM1Q15032 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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