Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSPNQ14714 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSPNQ14714 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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