Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCARF1Q14162 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCARF1Q14162 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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