Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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UBE4AQ14139 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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UBE4AQ14139 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBE4AQ14139 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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