Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COL9A2Q14055 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL9A2Q14055 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms