Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNGB1Q14028 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNGB1Q14028 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNGB1Q14028 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms