Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLF9Q13886 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms