Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALCAMQ13740 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALCAMQ13740 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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