Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MTMR3Q13615 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MTMR3Q13615 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms