Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SP140Q13342 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SP140Q13342 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SP140Q13342 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SP140Q13342 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SP140Q13342 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms