Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SRSF5Q13243 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SRSF5Q13243 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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